2010年2月，公司名称正式变更为“华润三九医药股份有限公司”。根据《华润三九品牌管理制度》、《华润三九CI 企业标识体系应用手册》，5月开始公司本部及下属企业全面启用新标识体系。新标识体系色彩鲜明，突出了华润元素并适当保留原三九医药特色。 

新标识体系的显著特点是将“999”系列商标从企业CI 标识体系中退出，突出华润三九的企业品牌。原“999”系列商标彻底转为产品品牌，主要用于深圳市三九医药贸易有限公司主渠道产品的销售和推广。公司标识体系与“999”系列商标分离，有效避免了商标滥用现象，对净化渠道，正确引导消费者，积极宣传企业形象，将起到良好效果。